Sinopse: Dez anos se passaram desde o fim de Bakumatsu, uma era de guerra que viu a revolta dos cidadãos contra o xogunato Tokugawa. Os revolucionários queriam criar um tempo de paz e um país próspero e livre da opressão. A nova era Meiji chegou, mas a paz ainda não foi alcançada. As espadas são proibidas, mas as pessoas ainda são assassinadas nas ruas. Os órfãos dos veteranos de guerra ficam sem ter para onde ir, enquanto o governo parece satisfeito em apenas encher os seus bolsos com dinheiro. Um samurai errante, Kenshin Himura, ainda trabalha para garantir que os valores pelos quais ele lutou valham as vidas gastas para trazer a nova era. Outrora conhecido como Hitokiri Battousai, ele era temido como o assassino mais cruel de todos os revolucionários. Agora assombrado pela culpa, Kenshin jurou nunca mais matar em expiação pelas vidas que tirou, e talvez nunca conheça a paz até que matar seja uma coisa do passado. Agora no 11º ano de Meiji, Kenshin se depara com Kaoru Kamiya, proprietário e instrutor-chefe de um pequeno dojo que está sendo ameaçado de fechar suas portas. A força policial é impotente para impedir a série de assassinatos cometidos em nome de seu dojo por um homem que afirma ser o famoso Battousai. As andanças de Kenshin param por enquanto quando ele se junta a Kaoru para limpar os nomes de ambos. Mas quanto tempo ele conseguirá ficar antes que seu passado o alcance? [Escrito por MAL Rewrite]